Etterforskningsregisteret inneholder DNA-profiler fra personer som er under etterforskning for en straffbar handling som kan medføre fengsel, forvaring eller samfunnsstraff. Kravet for å lagre en persons DNA-profil i etterforskningsregisteret er at det finnes skjellig grunn til mistanke om lovbrudd, dvs. over 50 prosent sannsynlighet for at personen er skyldig. Profiler i etterforskningsregisteret skal bare lagres midlertidig. Blir personen dømt, overføres profilen til identitetsregisteret. Ved frifinnelse eller hvis saken blir henlagt, skal profilen slettes. Per september 2021 var 3 885 personer registrert i etterforskningsregisteret.